پس از آنکه جینجر و بقیه مرغ‌ها توانستند از مزرعه توویدی فرار کنند، جزیره‌ای امن و آرام را برای پناهگاه پیدا کردند غافل از آنکه کل گونه مرغ‌ها با تهدید جدیدی روبه‌رو است و آن‌ها باید برای نجات دیگر مرغ‌ها برگردند.

“رودی” یک موش خوشتیپ و دست‌پاچلفتی است که زندگی پررفاهی دارد اما زمانی که می‌خواهد از دوست خپل و مزاحمش خلاص شود، در توالت می‌افتد و دوستش سیفون را روی او می‌کشد. او وارد فاضلاب می‌شود و متوجه می‌شود افسانه شهر موش‌ها واقعیت دارد و شهری مانند شهر انسان‌ها در فاضلاب بنا شده و موش‌ها مانند انسان‌ها در کنار یکدیگر زندگی می‌کنند…

پسر بچه ای برای نجات شهرش، ارواح، مردگان متحرک و بزرگترانش را جمع می کند و سعی می کند تا مانع وقوع مصیبتی بزرگ شود…