ناروتو، شیکامارو و ساکورا این بار به مأموریتی فرستاده شده‌اند تا حیوان دست‌آموز گمشده‌ای را به دهکده‌اش بازگردانند اما با جنگجوی اسرارآمیزی مواجه می‌شوند که...
ایزوکو یک پسر عادی هست که تنها آرزویش تبدیل شدن به یک قهرمان است. او در دنیایی متولد شده است که هشتاد درصد مردم قدرت ماورائی دارند ، اما ایزوکو جز آن افرادی هست که هیچ قدرتی ندارند. او برای همین همیشه از طرف بچه‌های دیگه مورد تمسخر قرار می‌گیرد. تا اینکه…
پس از قتل عامی بزرگ، توکیوکی به‌همراه خدمتکارانی وفادار فرار می‌کند که سووا یوریشیگه نیز همراه‌اش است، کسی که معتقد است روزی توکیوکی بر ژاپن حکمرانی خواهد کرد، اما فعلاً اولویت فرار از قلمروی دشمن است.
داستان در دو زمان 1997 و 2022 روایت می‌شود. زمانی که یک هوش مصنوعی به‌نام اسکای‌نت به خودآگاهی می‌رسد و جنگی را علیه بشریت آغاز می‌کند که در آینده یعنی سال 2022 همچنان جنگی بی‌رحمانه میان چند بازمانده از بشر و ارتشی از ربات‌ها ادامه دارد.
جوخه انتحار به‌همراه جوکر به دنیای دیگری می‌روند تا در آنجا نیز آشوب و هرج‌ومرج ایجاد کنند، غافل از آنکه باید طی 72 ساعت برگردند تا بمب‌های نانویی در سرشان منفجر نشود.
