با ظهور اولین جهش یافته ی دنیا که "آخرالزمان/Apocalypse" نام دارد، مردان ایکس باید با هم متحد شوند تا از نقشه ای که او برای انقراض نسل کشیده، جلوگیری کنند ...

مردان ایکس، ولوورین را به گذشته می فرستند تا از اتفاقی که منجر به نابودی انسان ها و جهش یافتگان در آینده می شود، جلوگیری کند...

لوگان (هیوجکمن) در ژاپن به سر می برد و در آنجا با سامورایی ها درگیر می شود و نبردی حماسی برای او رقم می خورد که زندگی او را برای همیشه تحت تاثیر قرار میدهد...

قبل از اینکه «چارلز ژاویر» (جیمز مک‌آووی) و «اریک لنشر» (مایکل فسبندر) به نام‌های پروفسور ایکس و مغناطیس مشهور شوند، دو مرد جوان بودند که به قدرت‌های بخصوصشان پی می بردند. قبل از اینکه به دشمنان قسم خورده تبدیل شوند، آن‌ها بهترین دوستان یکدیگر بودند و به همراه دیگر جهش یافتگان در مقابل بزرگترین تهدید جهان صف آرایی کردند. و در همان زمان بود که اولین اختلافات در بین آن دو شکل گرفت...

لوگان بعد از جستجو برای یک زندگی معمولی، برای گرفتن انتقام قتل نامزدش، به برنامه سلاح ایکس تن میدهد و تبدیل به وولورین میشود.

وقتی دارویی برای درمان ژن های حهش یافته پیدا می شود , انسان‌های جهش یافته به دو گروه تقسیم می شوند: «مردان ایکس»، که توسط پروفسور چارلز ژاویر رهبری می شود، و «برادری»، گروهی از جهش یافتگان قدرتمند که «مغناطیس»، دوست سابق پروفسور ژاویر در راس آن‌ها قرار دارد.

مردان ایکس گرد هم آمده‌اند تا یک مامور جهش یافته که قصد جان رئیس جمهور را کرده است، را بیابند. در پی این حادثه، آکادمی انسان‌های جهش یافته مورد حمله ارتش قرار می گیرد.

دو مرد با قدرت‌های خارق العاده به یک آکادمی خصوصی از هم نوعانشان می آیند. در واقع افراد این آکادمی تیمی از ابرقهرمان‌ها هستند که باید با یک تشکیلات تروریستی با قدرت‌های مشابه مقابله کند.

آنا که در کودکی توسط قاتل افسانه ای مودی نجات یافت ، ماهرترین قاتل قراردادی جهان است. با این حال ، هنگامی که مودی به طرز وحشیانه ای کشته می شود ، آنا قول می دهد تا انتقام استادش را بگیرد و…

یک نجیب زاده به نام بن هور به دروغ متهم به قتل دوست دوران کودکی اش میشود و سال ها در رم به عنوان یک برده به زندگی خود ادامه میدهد. اکنون او تلاش دارد تا انتقام بگیرد …